Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P10404 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P10404 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P10404 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
P10404 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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