Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC011939.1-201ENST00000567680 964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 CD226-202ENST00000577287 1009 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AL139353.2-201ENST00000549844 699 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 PSMC1P12-201ENST00000436509 1314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATXN8OSP0DMR3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 WFDC5-201ENST00000307971 1034 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATXN8OSP0DMR3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms