Protein–RNA interactions for Protein: O88704

Hcn1, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn1O88704 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hcn1O88704 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hcn1O88704 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms