Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stag2O35638 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms