Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm379J3QQ19 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms