Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Apol6B7ZC55 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Apol6B7ZC55 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms