Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top3bQ9Z321 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms