Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gpc6Q9R087 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gpc6Q9R087 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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