Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rfx5Q9JL61 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rfx5Q9JL61 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rfx5Q9JL61 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rfx5Q9JL61 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rfx5Q9JL61 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rfx5Q9JL61 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rfx5Q9JL61 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rfx5Q9JL61 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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