Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cab39lQ9DB16 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cab39lQ9DB16 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cab39lQ9DB16 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cab39lQ9DB16 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cab39lQ9DB16 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cab39lQ9DB16 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms