Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pdzd9Q9D9M4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Pdzd9Q9D9M4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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