Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmco5aQ9D9D5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms