Protein–RNA interactions for Protein: Q9D920

Borcs5, BLOC-1-related complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs5Q9D920 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Borcs5Q9D920 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms