Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc83Q9D4V3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms