Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syf2Q9D198 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms