Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Thumpd2Q9CZB3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms