Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms