Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCC1Q92922 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms