Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Med28Q920D3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Med28Q920D3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms