Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sash3Q8K352 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sash3Q8K352 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms