Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CrebrfQ8CDG5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CrebrfQ8CDG5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms