Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CcinQ8CDE2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CcinQ8CDE2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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