Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms