Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Als2cr12Q8BVM7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms