Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnf1Q7TSH7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms