Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms