Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms