Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trappc6aQ78XR0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trappc6aQ78XR0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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