Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssx9Q6XAS3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssx9Q6XAS3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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