Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LMOD2Q6P5Q4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMOD2Q6P5Q4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms