Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc18Q640L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc18Q640L5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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