Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms