Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms