Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Utp18Q5SSI6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Utp18Q5SSI6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms