Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trip13Q3UA06 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trip13Q3UA06 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms