Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc136Q3TVA9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc136Q3TVA9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms