Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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