Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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