Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NrepQ07475 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms