Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2lP62876 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2lP62876 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms