Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vsnl1P62761 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms