Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ppfia3P60469 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ppfia3P60469 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms