Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gsc2P56916 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms