Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PctpP53808 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PctpP53808 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PctpP53808 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PctpP53808 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PctpP53808 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PctpP53808 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms