Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gpc4P51655 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gpc4P51655 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms