Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja1O55176 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms