Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim18J3QNP2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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