Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pot1bH7BX60 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms