Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms