Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
4930447F04RikA2AFR2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
4930447F04RikA2AFR2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms